Das Dekanat leitet die Fakultät und ist für alle fakultätsübergreifenden Aufgaben zuständig, wie die Koordination von Forschung und Lehre, und die Verwaltung der Fakultät. Es bereitet die Beschlüsse des Fakultätsrats vor und führt sie aus. Es ist außerdem Ansprechpartner für das Präsidium und die Gremien der Universität. Im Rahmen des Haushaltsplans entscheidet es über die Verwendung des Fakultätsbudgets.

Dem Dekanat gehören der Dekan, die Prodekane für die einzelnen Fächer sowie Forschungsdekan und der Studiendekan an. Die Prodekane sind gleichzeitig die Leiter der jeweiligen Institute.

Der Fakultätsrat ist neben dem Dekanat das wichtigste Entscheidungsgremium der Fakultät. Zu seinen Aufgaben gehören die Beratung und ggf. Entscheidung über die Verwendung von Ressourcen der Fakultät wie Geld- und Sachmittel, Personal, Räume etc. Er entscheidet insbesondere auch über grundsätzliche Fragen der Forschung und Lehre innerhalb der Fakultät. Dazu gehören die Einrichtung oder Einstellung/Schließung von Studiengängen sowie die Entscheidung über Inhalte der Studien- und Prüfungsordnungen.

Der Fakultätsrat setzt sich zusammen aus gewählten Mitgliedern der Gruppe der Hochschullehrerinnen und Hochschullehrer, der Gruppe der wissenschaftlichen Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter, der Gruppe der Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter in Technik und Verwaltung und der Gruppe der Studierenden.

Fachschaften sind institutionelle studentische Selbstverwaltungen. Sie setzen sich aus allen Studierenden eines Instituts zusammen. Umgangssprachlich wird der Begriff "Fachschaft" für die gewählte Vertretung (Fachschaftsrat) bezeichnet.

Die beiden miteinander verwandten Fachbereiche Mathematik und Informatik haben sich bereits vor vielen Jahren zu einer gemeinsamen Fachschaft zusammen geschlossen - und dies auch mit der Gründung der Fakultät und der Institute beibehalten.